导入 Neo4j 数据¶
本文以一个示例说明如何使用 Exchange 将存储在 Neo4j 的数据导入NebulaGraph。
实现方法¶
Exchange 使用 Neo4j Driver 4.0.1 实现对 Neo4j 数据的读取。执行批量导出之前,用户需要在配置文件中写入针对标签(label)和关系类型(Relationship Type)自动执行的 Cypher 语句,以及 Spark 分区数,提高数据导出性能。
Exchange 读取 Neo4j 数据时需要完成以下工作:
-
Exchange 中的 Reader 会将配置文件中
exec
部分的 CypherRETURN
语句后面的语句替换为COUNT(*)
,并执行这个语句,从而获取数据总量,再根据 Spark 分区数量计算每个分区的起始偏移量和大小。 -
(可选)如果用户配置了
check_point_path
目录,Reader 会读取目录中的文件。如果处于续传状态,Reader 会计算每个 Spark 分区应该有的偏移量和大小。 -
在每个 Spark 分区里,Exchange 中的 Reader 会在 Cypher 语句后面添加不同的
SKIP
和LIMIT
语句,调用 Neo4j Driver 并行执行,将数据分布到不同的 Spark 分区中。 -
Reader 最后将返回的数据处理成 DataFrame。
至此,Exchange 即完成了对 Neo4j 数据的导出。之后,数据被并行写入NebulaGraph数据库中。
整个过程如下图所示。
数据集¶
本文以 basketballplayer 数据集为例。
环境配置¶
本文示例在 MacOS 下完成,以下是相关的环境配置信息:
-
硬件规格:
- CPU:Intel(R) Xeon(R) CPU E5-2697 v3 @ 2.60GHz
- CPU 内核数:14
- 内存:251 GB
- Spark:单机版,2.4.6 pre-build for Hadoop 2.7
- Neo4j:3.5.20 Community Edition
- NebulaGraph:3.6.0。
前提条件¶
开始导入数据之前,用户需要确认以下信息:
-
已经安装部署NebulaGraph 并获取如下信息:
- Graph 服务和 Meta 服务的的 IP 地址和端口。
- 拥有NebulaGraph写权限的用户名和密码。
- 已经编译 Exchange。详情请参见编译 Exchange。本示例中使用 Exchange 3.6.0。
- 已经安装 Spark。
- 了解NebulaGraph中创建 Schema 的信息,包括 Tag 和 Edge type 的名称、属性等。
操作步骤¶
步骤 1:在NebulaGraph中创建 Schema¶
分析数据,按以下步骤在NebulaGraph中创建 Schema:
-
确认 Schema 要素。NebulaGraph中的 Schema 要素如下表所示。
要素 名称 属性 Tag player
name string, age int
Tag team
name string
Edge Type follow
degree int
Edge Type serve
start_year int, end_year int
-
使用 NebulaGraph Console 创建一个图空间 basketballplayer,并创建一个 Schema,如下所示。
## 创建图空间 nebula> CREATE SPACE basketballplayer \ (partition_num = 10, \ replica_factor = 1, \ vid_type = FIXED_STRING(30)); ## 选择图空间 basketballplayer nebula> USE basketballplayer; ## 创建 Tag player nebula> CREATE TAG player(name string, age int); ## 创建 Tag team nebula> CREATE TAG team(name string); ## 创建 Edge type follow nebula> CREATE EDGE follow(degree int); ## 创建 Edge type serve nebula> CREATE EDGE serve(start_year int, end_year int);
更多信息,请参见快速开始。
步骤 2:配置源数据¶
为了提高 Neo4j 数据的导出速度,在 Neo4j 数据库中为相应属性创建索引。详细信息,参考 Neo4j 用户手册。
步骤 3:修改配置文件¶
编译 Exchange 后,复制target/classes/application.conf
文件设置数据源相关的配置。在本示例中,复制的文件名为neo4j_application.conf
。各个配置项的详细说明请参见配置说明。
{
# Spark 相关配置
spark: {
app: {
name: NebulaGraph Exchange 3.6.0
}
driver: {
cores: 1
maxResultSize: 1G
}
executor: {
memory:1G
}
cores:{
max: 16
}
}
# NebulaGraph 相关配置
nebula: {
address:{
graph:["127.0.0.1:9669"]
#任意一个 Meta 服务的地址。
#如果您的 NebulaGraph 在虚拟网络中,如k8s,请配置 Leader Meta的地址。
meta:["127.0.0.1:9559"]
}
user: root
pswd: nebula
space: basketballplayer
connection: {
timeout: 3000
retry: 3
}
execution: {
retry: 3
}
error: {
max: 32
output: /tmp/errors
}
rate: {
limit: 1024
timeout: 1000
}
}
# 处理点
tags: [
# 设置 Tag player 相关信息。
{
name: player
type: {
source: neo4j
sink: client
}
server: "bolt://192.168.*.*:7687"
user: neo4j
password:neo4j
database:neo4j
exec: "match (n:player) return n.id as id, n.age as age, n.name as name"
fields: [age,name]
nebula.fields: [age,name]
vertex: {
field:id
# udf:{
# separator:"_"
# oldColNames:[field-0,field-1,field-2]
# newColName:new-field
# }
# 为 VID 增加指定的前缀。例如 VID 为 12345,增加前缀 tag1 后为 tag1_12345。下划线无法修改。
# prefix:"tag1"
# 对 string 类型的 VID 进行哈希化操作。
# policy:hash
}
# 批量操作类型,包括 INSERT、UPDATE 和 DELETE。默认为 INSERT。
#writeMode: INSERT
# 批量删除时是否删除该点关联的出边和入边。`writeMode`为`DELETE`时该参数生效。
#deleteEdge: false
partition: 10
batch: 1000
check_point_path: /tmp/test
}
# 设置 Tag team 相关信息。
{
name: team
type: {
source: neo4j
sink: client
}
server: "bolt://192.168.*.*:7687"
user: neo4j
password:neo4j
# bolt 3 does not support `select database`, please do not config database
# database:neo4j
exec: "match (n:team) return n.id as id,n.name as name order by id(n)"
fields: [name]
nebula.fields: [name]
vertex: {
field:id
}
partition: 10
batch: 1000
check_point_path: /tmp/test
}
]
# 处理边数据
edges: [
# 设置 Edge type follow 相关信息
{
name: follow
type: {
source: neo4j
sink: client
}
server: "bolt://192.168.*.*:7687"
user: neo4j
password:neo4j
# bolt 3 不支持多数据库,请勿配置数据库名。4 及以上可以配置数据库名。
# database:neo4j
exec: "match (a:player)-[r:follow]->(b:player) return a.id as src, b.id as dst, r.degree as degree order by id(r)"
fields: [degree]
nebula.fields: [degree]
source: {
field: src
# udf:{
# separator:"_"
# oldColNames:[field-0,field-1,field-2]
# newColName:new-field
# }
# 为 VID 增加指定的前缀。例如 VID 为 12345,增加前缀 tag1 后为 tag1_12345。下划线无法修改。
# prefix:"tag1"
# 对 string 类型的 VID 进行哈希化操作。
# policy:hash
}
target: {
field: dst
# udf:{
# separator:"_"
# oldColNames:[field-0,field-1,field-2]
# newColName:new-field
# }
# 为 VID 增加指定的前缀。例如 VID 为 12345,增加前缀 tag1 后为 tag1_12345。下划线无法修改。
# prefix:"tag1"
# 对 string 类型的 VID 进行哈希化操作。
# policy:hash
}
#ranking: rank
# 批量操作类型,包括 INSERT、UPDATE 和 DELETE。默认为 INSERT。
#writeMode: INSERT
partition: 10
batch: 1000
check_point_path: /tmp/test
}
# 设置 Edge type serve 相关信息
{
name: serve
type: {
source: neo4j
sink: client
}
server: "bolt://192.168.*.*:7687"
user: neo4j
password:neo4j
exec: "match (a:player)-[r:serve]->(b:team) return a.id as src, b.id as dst, r.start_year as start_year, r.end_year as end_year order by id(r)"
fields: [start_year,end_year]
nebula.fields: [start_year,end_year]
source: {
field: src
}
target: {
field: dst
}
partition: 10
batch: 1000
check_point_path: /tmp/test
}
]
}
exec 配置说明¶
在配置tags.exec
或者edges.exec
参数时,需要填写 Cypher 查询语句。为了保证每次查询结果排序一致,并且为了防止在导入时丢失数据,强烈建议在 Cypher 查询语句中加入ORDER BY
子句,同时,为了提高数据导入效率,最好选取有索引的属性作为排序的属性。如果没有索引,用户也可以观察默认的排序,选择合适的属性用于排序,以提高效率。如果默认的排序找不到规律,用户可以根据点或关系的 ID 进行排序,并且将partition
设置为一个尽量小的值,减轻 Neo4j 的排序压力。
说明:使用
ORDER BY
子句会延长数据导入的时间。
另外,Exchange 需要在不同 Spark 分区执行不同SKIP
和LIMIT
的 Cypher 语句,所以在tags.exec
和edges.exec
对应的 Cypher 语句中不能含有SKIP
和LIMIT
子句。
tags.vertex 或 edges.vertex 配置说明¶
NebulaGraph在创建点和边时会将 ID 作为唯一主键,如果主键已存在则会覆盖该主键中的数据。所以,假如将某个 Neo4j 属性值作为NebulaGraph的 ID,而这个属性值在 Neo4j 中是有重复的,就会导致重复 ID,它们对应的数据有且只有一条会存入NebulaGraph中,其它的则会被覆盖掉。由于数据导入过程是并发地往NebulaGraph中写数据,最终保存的数据并不能保证是 Neo4j 中最新的数据。
check_point_path 配置说明¶
如果启用了断点续传功能,为避免数据丢失,在断点和续传之间,数据库不应该改变状态,例如不能添加数据或删除数据,同时,不能更改partition
数量配置。
步骤 4:向NebulaGraph导入数据¶
运行如下命令将文件数据导入到NebulaGraph中。关于参数的说明,请参见导入命令参数。
${SPARK_HOME}/bin/spark-submit --master "local" --class com.vesoft.nebula.exchange.Exchange <nebula-exchange-3.6.0.jar_path> -c <neo4j_application.conf_path>
Note
JAR 包有两种获取方式:自行编译或者从 maven 仓库下载。
示例:
${SPARK_HOME}/bin/spark-submit --master "local" --class com.vesoft.nebula.exchange.Exchange /root/nebula-exchange/nebula-exchange/target/nebula-exchange-3.6.0.jar -c /root/nebula-exchange/nebula-exchange/target/classes/neo4j_application.conf
用户可以在返回信息中搜索batchSuccess.<tag_name/edge_name>
,确认成功的数量。例如batchSuccess.follow: 300
。
步骤 5:(可选)验证数据¶
用户可以在NebulaGraph客户端(例如 NebulaGraph Studio)中执行查询语句,确认数据是否已导入。例如:
LOOKUP ON player YIELD id(vertex);
用户也可以使用命令 SHOW STATS
查看统计数据。
步骤 6:(如有)在NebulaGraph中重建索引¶
导入数据后,用户可以在NebulaGraph中重新创建并重建索引。详情请参见索引介绍。